Исследователи из Critical Analytics for Manufacturing Personalized-Medicine (CAMP), междисциплинарной исследовательской группы (IRG) в Singapore-MIT Alliance for Research and Technology (SMART) и исследовательского предприятия Массачусетского технологического института в Сингапуре разработали новый метод быстрого и точного обнаружения вирусных нуклеиновых кислот.
Новая методика CAMP - RApid DIgital Crispr Approach (RADICA) - позволяет проводить абсолютное количественное определение вирусных нуклеиновых кислот за 40-60 минут изотермическим способом на водяной бане. Метод RADICA был протестирован на синтетических нуклеиновых кислотах SARS-CoV-2 и вируса Эпштейна-Барра. С помощью RADICA также можно отличить вирус от его близких родственников. Команда использует извлеченную нуклеиновую кислоту (ДНК / РНК) из образца и делит 15 мкл реакционной среды на тысячи независимых частей. В каждом образце нуклеиновая кислота (ДНК / РНК) амплифицируется и идентифицируется белком Cas12a, ферментом, который может превращать целевой сигнал в флуоресцентный сигнал. Это позволяет проводить абсолютную количественную оценку путем подсчета количества подсвеченных областей, содержащих целевую ДНК / РНК.
Предлагаемый метод по сравнению с существующими быстрее, дешевле и эффективнее. А цифровой формат делает его более устойчивым к загрязнению или ингибиторам, которые могут присутствовать в биологических образцах, что часто бывает с продуктами клеточной терапии или биологическими образцами. Авторы разработки отмечают, что помимо обнаружения наличия целевого вируса, RADICA также определяет количество вирусов в образце, что может помочь врачам и исследователям в выборе курса лечения.