Группа израильских ученых провела РНК-секвенирование единичных T-клеток, в которые были трансфецированы CRISPR-Cas9 и гидовая РНК, нацеленная на гены цепей TCR и PD-1. Спустя четыре дня после трансфекции порядка 9 % клеток теряли локус 14 хромосомы, в котором расположен ген TCRα, а в 9,9 % клеток была укорочена хромосома
7, несущая локус TCRβ. Выявленные аберрации были валидированы с применением гибридизации in situ, а также при помощи цифровой капельной ПЦР. При этом клеткам, несущим хромосомные аберрации, были свойственны низкая пролиферативность и индукция p53, что приводило к гибели этих клеток. Несмотря на предполагаемую полную элиминацию дефектных клеток, спустя 11 дней после трансфекции хромосомные аберрации были выявлены в 0,9 % всей фракции.

Обнаруженный факт анеуплоидных клеток среди T-клеток, подготовленных для клеточнойтерапии, должен быть принят во внимание при дальнейшем клиническом применении технологии, основанной на использовании CRISPR- Cas9.

Первоисточник:
Nahmad A.D., Reuveni E., Goldschmidt E. et al., Frequent aneuploidy in primary human T cells after CRISPR–Cas9 cleavage, Nature Biotechnology/DOI: 10.1038/s41587-022-01377-0