Рибосомы эукариот распознают мРНК с 5’-кэп структурами, за которыми следует нетранслируемая область.
Рибосомы эукариот распознают мРНК с 5’-кэп структурами, за которыми следует нетранслируемая область. Современные данные указывают, что транскрипция может начаться в 5’ нетранслируемых регионах у значительной части эукариотических мРНК. Иногда это происходит экстремально близко к 5’-кэп структуре, что приводит к смещению рамки считывания. Значительное число одноцепочечных РНК вирусов с отрицательной цепью используют 5’- кэп структуры хозяина в процессе транскрипции собственных генов, применяя механизм cap snatching, в процессе которого воспроизводятся генетические гибриды последовательностей мРНК хозяина и вируса.
Международная группа исследователей во главе с I. Marazzi (Медицинская школа Икан Маунт-Синай) предположила и описала механизм, позволяющий одноцепочечным РНК вирусам с отрицательной цепью генерировать химерные гены "хозяин-вирус". Проведенный анализ показал, что приблизительно в 10% мРНК вируса гриппа А содержится производные от «хозяина» uAUG (upstream AUG, стартовый кодон). uvORFs (upstream viral open reading frame) транслируются как минимум в трех из восьми сегментах генома вируса гриппа А. На моделях с мышиными клетками ученые подтвердили свои предположения: химерные белки экспрессировались в инфицированных клетках и вызывали Т-клеточный ответ.