Иммунная функция традиционно считается прерогативой гемопоэтических клеток. Эпителий и эндотелий с иммунологической точки зрения обычно рассматриваются в контексте их барьерной функции, а фибробластам отводится роль в поддержании структуры стромы. Данные последних лет указывают на более сложные механизмы взаимодействия этих клеток с клетками иммунной системы и их активное участие в иммунном ответе.

Авторы исследования, проведенного в научных центрах Австрии и Германии и опубликованного в журнале Nature, использовали мультиомиксный подход для изучения роли в иммунном ответе эпителия, эндотелия и фибробластов, выделенных из 12 различных органов мышей. Указанные типы клеток авторы обозначили термином «структурные клетки», а их роль в иммунном ответе описали как «структурный иммунитет» (structural immunity). В работе использовались передовые методики для оценки экспрессии генов, эпигенетической регуляции и степени открытости хроматина: RNA-seq, CHiPmentation, ATAC-seq. Была исследована экспрессия генов в нормальных условиях и при вирусной инфекции. Оказалось, что экспрессия генов, регулирующих иммунный ответ, в структурных клетках является органоспецифической. Для каждого органа характерен определенный профиль экспрессируемых белков

(например, хемокинов), отвечающих за коммуникации с клетками иммунной системы. Причем, этот профиль в большей степени схож между разными типами клеток в одном органе, чем между одинаковыми типами клеток в разных органах. Для иллюстрации авторы смоделировали сеть межклеточных взаимодействий структурных клеток с клетками иммунной системы в разных органах.

Работа представляет собой наиболее полное на сегодняшний день сравнительное исследование транскрипционной и эпигенетической регуляции иммунного ответа, опосредованного структурными клетками в разных органах.