ISSN Print 2306-6326    ISSN Online 2713-2773
НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКИЙ РЕЦЕНЗИРУЕМЫЙ ЖУРНАЛ ФМБА РОССИИ

Новости журнала

03.08.2021
R2: масштабный атлас РНК человека, включающий новые некодирующие РНК

Существующие базы данных некодирующих РНК (нкРНК) неполны, в том числе потому, что они составлены почти исключительно по данным РНК-секвенирования малых и полиаденилированных РНК.  Усилиями исследователей США, Европы и Австралии был составлен наболее полный атлас человеческого транскриптома, который включает проаннотированные последовательности малых и полиА РНК, а также последовательности РНК полного транскриптома более чем 300 типов тканей и клеточных культур человека.

Выявлены тысячи ранее не охарактеризованных РНК, что суммарно увеличило количество задокументированных нкРНК примерно на 8%. Чтобы сделать вывод о функциональной регуляции с помощью известных и недавно охарактеризованных нкРНК, была проведена оценка количества пре-мРНК при тотальном секвенирования РНК, что позволило выявить 316 микроРНК и 3310 длинных нкРНК и описать их функции в регуляции активности ряда генов и сигнальных путей. 

 

Проведенное исследование внесло значительный вклад в расширение научного знания о функциях РНК ввиду выполнения многокомпонентного анализа состава разных типов РНК. Результаты исследования представлены в виде мультипараметрической платформы для анализа и визуализации данных, доступной онлайн: R2 (Genomics Analysis and Visualization Platform).

 

Исследование выявило множество  некодирующих РНК человека, что позволило значительно пополнить базы данных  сведдениями о характеристиках различных типов РНК и выявить новые регуляторные взаимодействия.