Исследователи из Технологического института Джорджии (США) разработали вычислительный инструмент под названием SpatialVizScore, использующий данные мультиплексной визуализации для количественной оценки паттернов инфильтрации иммунными клетками опухолей в окружающей их микросреде как с разрешением на уровне одной клетки, так и с разрешением на уровне пикселей для идентификации отдельных областей ткани.

Опухоли делятся на два типа. Первый тип – иммунные "холодные" опухоли – характеризуются низкой инфильтрацией
иммунных клеток. Иногда к этому типу относятся иммуносупрессивные опухоли, отличающиеся повышенным содержанием иммунных клеток с биомаркерами FoxP3 и CD4+. Второй тип – иммунные "горячие" опухоли – с высокой степенью инфильтрации иммунными клетками с биомаркерами GranzymeB, CD45RO и CD3+.

Сочетание SpatialVizScore с клиническими данными пациентов, а также мультиомиксное профилирование биопсий могут способствовать дальнейшей валидации этого нового инструмента и его внедрения в клиническую практику.

Инструмент SpatialVizScore позволяет получить дискретную стратификацию пациентов, необходимую для разработки персонализированной прецизионной иммунотерапии. Этот алгоритм может применяться к различным типам злокачественных новообразований и большим когортам пациентов.

Первоисточник:
Allam, M., Hu, T., Lee, J. et al., Spatially variant immune infiltration scoring in human cancer tissues., npj Precision Oncology, № 6, стр. 60 (2022)/DOI: 10.1038/s41698-022-00305-4