Анализ данных поклеточного секвенирования РНК (технология sc-RNAseq) позволяет описать существование различных субпопуляций в первичных опухолях. При этом не разработано методик для оценки реального функционального состояния этих гетерогенных групп клеток.

Количество смертей от рака лёгкого составляет 18,4% от числа смертей по причине онкологических заболеваний в мире. Перед каждым онкотерапевтом стоит важная задача нахождения компромисса между тем, чтобы уничтожить наибольшее число опухолевых клеток и тем, чтобы избежать серьёзных побочных эффектов терапии. Химиотерапия противоопухолевыми препаратами гемцитабин и карбоплатин, применяемыми в терапии немелкоклеточного рака легкого, часто индуцирует миелосупрессию, что включает в себя нейтропению, лейкопению и тромбоцитопению. Группа ученых из Швеции исследовала ДНК 96 пациентов с диагностированным немелкоклеточным раком легкого и прошедших терапию этими препаратами и сопоставила результаты полногеномного секвенирования с тяжестью побочных эффектов противоопухолевой терапии на костный мозг.

Жидкостная биопсия – это метод детекции новообразований путем обнаружения циркулирующих в крови пациента фрагментов ДНК опухоли. Этот метод хорошо зарекомендовал себя для некоторых типов опухолей, однако в случае опухолей мозга его применение затруднено из-за недостаточно высокой концентрации мутантной опухолевой ДНК в крови. Группа ученых из Массачусетса (США) разработала метод, основанный на капельной цифровой ПЦР, позволяющий обнаруживать мутантную ДНК в плазме крови пациентов с глиомой с чувствительностью 62,5%.

Поиск молекулярно-генетических изменений в плоскоклеточном раке легкого с последующей терапией против мишени – один из развивающихся подходов в лечении этой опухоли. Исследование Lung-MAP (S1400) было проведено в рамках Национальной сети клинических испытаний NCI.

Подходы эпигенетической терапии рака, направленные на подавление клеточных механизмов репрессии транскрипции генов, могут оказывать положительный эффект за счет активации ретроэлементов генома. Активные ретроэлементы продуцируют двуцепочечную РНК, которая стимулирует фактор MDA5, являющийся рецептором опознавания паттерна, что в конечном счете приводит к активации врожденного и приобретенного иммунитета. Однако на данный момент клиническая эффективность эпигенетической терапии весьма ограничена, а спектр индуцируемых под ее влиянием иммуногенных ретроэлементов плохо изучен.