МЕТОД

Разработка тест-системы для диагностики COVID-19 в формате ОТ-ПЦР в режиме реального времени

А. К. Шуряева1, Т. В. Малова1, Е. Е. Давыдова2, Ю. А. Савочкина1, Е. В. Богословская1, Р. Р. Минтаев1,2, Г. М. Цыганова1, Е. Е. Шивлягина1, А. Ш. Ибрагимова1, А. О. Носова1, Г. А. Шипулин1, С. М. Юдин1
Информация об авторах

1 Федеральное государственное бюджетное учреждение "Центр стратегического планирования" Федерального медико-биологического агентства России, Москва, Россия

2 Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова Российской академии наук, Москва, Россия

Информация о статье

Финансирование: исследование проведено за счет собственных средств ФГБУ “ЦСП” ФМБА России.

Статья получена: 15.07.2020 Статья принята к печати: 13.08.2020 Опубликовано online: 19.08.2020
|

В конце декабря 2019 года в городе Ухань, Китай, возникла вспышка неизвестного коронавируса, позднее идентифицированного как SARS-CoV-2. Вирус вызывает опасное респираторное коронавирусное заболевание человека - COVID-19.
Цель. Для выявления случаев заболевания и предотвращения его распространения на территории Российской Федерации необходимо создание эффективной диагностической тест-системы.
Материалы и методы. На основании анализа выравнивания нуклеотидных последовательностей SARS-CoV-2 были выбраны праймеры и зонд для ОТ-ПЦР, оптимизированы условия проведения анализа.
Результаты. В кратчайшие сроки разработана и зарегистрирована диагностическая система в формате ОТ-ПЦР в реальном времени для выявления РНК коронавируса SARS-CoV-2 в мазках со слизистой оболочки носоглотки и ротоглотки, мокроте и фекалиях. Высокая специфичность системы показана на репрезентативной выборке генетического материала вирусного и бактериального происхождения, аналитическая чувствительность составила 1х103 ГЭ/мл в мазках со слизистой носоглотки и ротоглотки и мокроте, 5х104 ГЭ/мл в образцах фекалий. Диагностические показатели (чувствительность и специфичность), установленные при клинических испытаниях на образцах, полученных от пациентов с подтвержденной инфекцией COVID-19, от пациентов с иной этиологией заболевания и клинически здоровых людей, составили 100% (диапазон 94,2-100 % с доверительной вероятностью 95 %).

Ключевые слова: коронавирус, молекулярная диагностика, SARS-CoV-2, COVID-19, SARS-COV-2, ОТ-ПЦР в реальном времени, диагностика инфекционных заболеваний

КОММЕНТАРИИ (0)