2020 / 03

Следующая статья
DOI: 10.47183/mes.2020.011

МЕТОД

Разработка тест-системы для диагностики COVID-19 в формате ОТ-ПЦР в режиме реального времени

А. К. Шуряева1, Т. В. Малова1, Е. Е. Давыдова2, Ю. А. Савочкина1, Е. В. Богословская1, Р. Р. Минтаев1,2, Г. М. Цыганова1, Е. Е. Шивлягина1, А. Ш. Ибрагимова1, А. О. Носова1, Г. А. Шипулин1, С. М. Юдин1
Информация об авторах

1 Федеральное государственное бюджетное учреждение "Центр стратегического планирования" Федерального медико-биологического агентства России, Москва, Россия

2 Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова Российской академии наук, Москва, Россия

Информация о статье

Финансирование: исследование проведено за счет собственных средств ФГБУ “ЦСП” ФМБА России.

Статья получена: 15.07.2020 Статья принята к печати: 13.08.2020 Опубликовано online: 19.08.2020
|
Рисунок. Выравнивание последовательностей геномов коронавирусов SARS-CoV-2, OC43, HKU1, SARS, MERS, 229E и NL63 в области конструирования праймеров и зонда.
Таблица 1. Результаты повторных клинических испытаний (оценка диагностической чувствительности и специфичности) набора реагентов
Таблица 2. Результаты множественного выравнивания 50386 известных последовательностей генома коронавируса SARS-CoV-2, представленных в базе данных GISAID в областях выбранных праймеров и зонда. В столбцах указано: 1 – порядковый номер нуклеотида по референсной последовательности MN985325, 2-5 выявленные полиморфизмы среди проанализированных последовательностей в данном положении, 6 - количество последовательностей геномов SARS-CoV-2 в базе данных GISAID, не имеющих отличия в конкретной позиции с MN985325, 7 – количество последовательностей геномов SARS-CoV-2 GISAID, имеющих отличие в конкретной позиции, 8 - количество последовательностей геномов SARS-CoV-2 GISAID, в которых в конкретной позиции нуклеотид не установлен.