2020 / 03

Следующая статья
DOI: 10.47183/mes.2020.011

МЕТОД

Разработка тест-системы для диагностики COVID-19 в формате ОТ-ПЦР в режиме реального времени

А. К. Шуряева1, Т. В. Малова1, Е. Е. Давыдова2, Ю. А. Савочкина1, Е. В. Богословская1, Р. Р. Минтаев1,2, Г. М. Цыганова1, Е. Е. Шивлягина1, А. Ш. Ибрагимова1, А. О. Носова1, Г. А. Шипулин1, С. М. Юдин1
Информация об авторах

1 Федеральное государственное бюджетное учреждение "Центр стратегического планирования" Федерального медико-биологического агентства России, Москва, Россия

2 Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова Российской академии наук, Москва, Россия

Информация о статье

Финансирование: исследование проведено за счет собственных средств ФГБУ “ЦСП” ФМБА России.

Статья получена: 15.07.2020 Статья принята к печати: 13.08.2020 Опубликовано online: 19.08.2020
|
  1. Bogoch I. I. et al. Pneumonia of unknown aetiology in Wuhan, China: potential for international spread via commercial air travel // Journal of travel medicine. 2020. Vol. 27. №. 2. P.1-3.
  2. Hui D. S. et al. The continuing 2019-nCoV epidemic threat of novel coronaviruses to global health—The latest 2019 novel coronavirus outbreak in Wuhan, China // International Journal of Infectious Diseases. 2020. Vol. 91. P. 264-266.
  3. Rothan H. A., Byrareddy S. N. The epidemiology and pathogenesis of coronavirus disease (COVID-19) outbreak // Journal of autoimmunity. – 2020. P. 1-4.
  4. Chan J. F. W. et al. Middle East respiratory syndrome coronavirus: another zoonotic betacoronavirus causing SARS-like disease // Clinical microbiology reviews. 2015. Vol. 28. №. 2. P. 465-522.
  5. Elfiky A. A., Mahdy S. M., Elshemey W. M. Quantitative structure activity relationship and molecular docking revealed a potency of anti-hepatitis C virus drugs against human corona viruses // Journal of medical virology. 2017. Vol. 89. №. 6. P. 1040-1047.
  6. Ibrahim I. M. et al. COVID-19 spike-host cell receptor GRP78 binding site prediction // Journal of Infection. 2020. Vol. 80. №. 5. P. 554-562.
  7. WHO: Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) – The Kingdom of Saudi Arabia Retrieved. 24 February 2020. URL: https://www.who.int/csr/don/24-february-2020-mers-saudi-arabia/en/
  8. John Hopkins University. Coronavirus Resourse Center. [Электронный ресурс] URL: https://coronavirus.jhu.edu/map.html. Дата обращения: 30.06.2020.
  9. Van Pelt-Verkuil E., van Belkum A., Hays J.P. Principles and Technical Aspects of PCR Amplification. – Springer Science & Business Media, 2008.
  10. Yuryev A. Methods in Molecular Biology: PCR Primer Design. Totowa, New Jersey: Humana Press, 2007.
  11. Kibbe W.A. OligoCalc: an online oligonucleotide properties calculator. Nucleic. Acids Res. 2007. URL: http://biotools.nubic.northwestern.edu/OligoCalc.html.
  12. Integrated DNA Technologies. OligoAnalyzer Tool. URL: https://www.idtdna.com/pages/tools/oligoanalyzer.
  13. The mfold Web Server (Hosted by The RNA Institute, College of Arts and Sciences). URL: http://unafold.rna.albany.edu/?q=mfold/DNA-Folding-Form.
  14. Cheng Y, Niu J, Zhang Y, Huang J, Li Q. Preparation of his-tagged armored RNA phage particles as a control for real-time reverse transcription-PCR detection of severe acute respiratory syndrome coronavirus // J Clin Microbiol. 2006; 44:3557–62.
  15. Pasloske BL, Walkerpeach CR, Obermoeller RD, Winkler M, Du Bois DB. Armored RNA technology for production of ribonuclease-resistant viral RNA controls and standards // J Clin Microbiol. 1998;36(12):3590–4.
  16. Яцышина С. Б. и др. Лабораторная диагностика гриппа и других ОРВИ методом полимеразной цепной реакции // Лабораторная служба. 2017. Т. 6. №. 3. С. 238-267.
  17. Sanchez, C. M., F. Gebauer, C. Sune, A. et al. Genetic evolution and tropism of transmissible gastroenteritis coronaviruses // Virology. – 1992. P. 92-105.
  18. Hatim T. Allawi and John SantaLucia, Jr. Nearest-Neighbor Thermodynamics of Internal A‚C Mismatches in DNA: Sequence Dependence and pH Effects // Biochemistry. 1998. 37. 9435-9444.