ISSN Print 2306-6326
ISSN Online 2713-2773
НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКИЙ РЕЦЕНЗИРУЕМЫЙ ЖУРНАЛ ФМБА РОССИИ
ОРИГИНАЛЬНОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ
Взаимодействие катионных антисептиков с кардиолипинсодержащей модельной бактериальной мембраной
Информация об авторах
1 Федеральный научно-клинический центр специализированных видов медицинской помощи и медицинских технологий Федерального медико-биологического агентства, Москва, Россия
2 Московский государственный университет имени М. В. Ломоносова, Москва, Россия
Для корреспонденции: Илья Борисович Коваленко
ул. Ореховый бульвар, д. 28, 115682, г. Москва; moc.liamg@87oknelavoki
Информация о статье
Финансирование: исследование выполнено при финансовой поддержке РФФИ в рамках научного проекта № 19-34-90045 и государственного задания «Влияние липидного состава бактериальных мембран на процессы взаимодействия с антимикробными соединениями», шифр: «Мембрана».
Вклад авторов: Е. Г. Холина — создание молекулярных моделей исследуемых веществ, проведение расчетов, написание текста статьи; М. Е. Боздаганян — проведение расчетов, написание текста статьи; М. Г. Страховская — идея исследования, написание текста статьи, анализ результатов; И. Б. Коваленко — идея исследования, создание вычислительной инфраструктуры, написание текста статьи, анализ результатов.
Статья получена: 19.07.2021
Статья принята к печати: 21.08.2021
Опубликовано online: 11.09.2021
|
Рис. 1. Химические структуры КА с наложенными на них крупнозернистыми частицами. А. Мирамистин (MIR). Б. Хлоргексидин (CHL). В. Пиклоксидин (PIC); Г. Октенидин (OCT). Крупнозернистые частицы выделены разными цветами в соответствии с выбранными типами частиц в силовом поле MARTINI (нижняя часть панели А)
Рис. 2. Характеристики модельной мембраны состава POPE:POPG:CDL2 в присутствии КА в различной концентрации. А. Коэффициенты латеральной диффузии для липидов POPE (слева), POPG (посередине) и для СDL2 (справа). Б. Толщина бислоя. В. Площадь на липид. (Значения параметров для модельной мембраны без добавления КА показаны серым цветом)
Рис. 3. Эффект кластеризации CDL2 в присутствии антисептика OCT в соотношении КА : липид 1 : 4. А. Кадр МД расчета в момент времени 15 мкс. Липиды POPE показаны зеленым, POPG — розовым, CDL2 — красным, OCT — синим. Остатки фосфатов показаны черным, заряженные частицы молекул OCT — фиолетовым. Б. Профили плотности различных компонентов модельной мембраны. Профиль плотности для жирнокислотных цепей липидов показан розовым, заряженные частицы OCT — циановым, терминальные частицы OCT — голубым, NH3 частица (этанол) POPE липида — фиолетовым, GL0 частица (глицерол) POPG липида — зеленым. Серыми пунктирными линиями отмечены положения фосфатов, проведенные через центры соответствующих пиков. Профили плотности для жирнокислотных цепей, нормированные на максимум пикового значения, показаны по второй оси ординат (справа)
Рис. 4. Эффект вырывания липидов молекулами OCT из модельного бислоя. Соотношение КА : липид равно 1 : 4. А. Последовательные кадры МД расчета в разные моменты времени. Липиды POPE показаны зеленым, POPG — розовым, CDL2 — красным, OCT — синим. Остатки фосфатов показаны черным, заряженные частицы молекул OCT — фиолетовым. Б. Количество вырванных из бислоя липидов в зависимости от времени МД расчета
Таблица. Соотношение фосфатидитлэтаноламина (PE), фосфатидилглицерола (PG), кардиолипина (CL) в составе плазматической мембраны некоторых видов грамотрицательных (–) и грамположительных (+) бактерий [13, 14]
